1 ноября 2008
ЦСКА – «Спартак» — 0:1
Стадион «Лужники»

Во второй половине сезона-2008 «Спартак» прервал семиматчевую победную серию «армейцев» в чемпионате благодаря единственному голу Никиты Баженова. В своём первом дерби в качестве главного судьи на 84-й минуте Алексей Николаев показал полузащитнику хозяев Юрию Жиркову жёлтую карточку за очень агрессивный спор с боковым арбитром по поводу назначенного углового у ворот Игоря Акинфеева. Получив «горчичник», Юрий столкнулся с Николаевым, судья расценил это как намеренный выпад в свой адрес и без колебаний достал красную карточку. Эпизод вызвал очень много споров, а президент ЦСКА Евгений Гинер и главный тренер команды Валерий Газзаев намекали, что самый молодой российский рефери ФИФА, 37-летний Николаев, не справился с крайне ответственным заданием и своим решением повлиял на результат дерби.

20 ноября 2010
ЦСКА – «Спартак» — 3:1
Стадион «Арена Химки»

В 2010 году Алексей Николаев отметился сразу двумя удалениями. Сначала арбитр показал две жёлтые карточки одному из самых жёстких игроков в истории российской Премьер-Лиги, Дейвидасу Шемберасу: за грубый подкат под Эйдена Макгиди и за слишком активную полемику с судейской бригадой. Несмотря на меньшинство, игроки ЦСКА смогли одержать волевую победу: на точный дальний удар спартаковца Ибсона «армейцы» ответили голами Кейсуке Хонды, Сейду Думбия и Вагнера Лава. Николаев уравнял составы только на 90-й минуте, удалив Николаса Пареху за грубый удар Вагнера сзади. 

28 апреля 2012
ЦСКА – «Спартак» 2:1
Стадион «Лужники»

На этот раз ЦСКА победил «Спартак» в «Лужниках» благодаря дублю Зорана Тошича, а Алексей Николаев к 81-й минуте показал две жёлтые карточки защитнику «Спартака» Дмитрию Комбарову за грубые фолы против Думбия и Секу Олисе. Всего в этом матче рефери показал 8 жёлтых карточек. СМИ и эксперты сошлись в том, что Николаев безукоризненно отсудил дерби и не допустил ни малейшей ошибки в одном из важнейших матчей сезона.

22 сентября 2013
«Спартак» – ЦСКА — 3:0
Стадион «Локомотив»

В 2013 году на «Локомотиве» красно-белые разгромили принципиальных соперников. Авторами голов стали Араз Озбилиз, Дмитрий Комбаров и Сергей Паршивлюк. В этом матче ближе всех к удалению были защитник ЦСКА Кирилл Набабкин и форвард «Спартака» Юра Мовсисян, не поделившие пространство во вратарской площади Игоря Акинфеева. Николаев моментально разнял бодающихся соперников и наградил каждого «горчичником». Роман Асхабадзе, который на тот момент был генеральным директором «Спартака», отметил высокую квалификацию арбитра: «Все решения рефери тогда были чёткими, по делу, не могу припомнить ни одной ошибки».

17 мая 2015
«Спартак» – ЦСКА — 0:4
Стадион «Открытие Арена»

Первое дерби на «Открытие Арене» осталось за «армейцами». Уже на 11-й минуте Сердар Таски отправил мяч головой в правую девятку своих ворот, затем Роман Ерёменко мощным ударом удвоил преимущество, а на 30-й Тошич оформил разгром. После столь активной игры гостей главному судье Алексею Николаеву пришлось успокаивать болельщиков на трибунах: на 47-й минуте матч был приостановлен на несколько минут из-за дыма от пиротехники с гостевой трибуны. В целом это дерби стал самым спокойным для Николаева: арбитр показал всего 4 «горчичника» и ни одной красной карточки.

МНЕНИЕ

Владимир Левитин, арбитр всесоюзной категории:
— Алексей Николаев – классный судья, который по интеллекту превосходит всех остальных арбитров процентов на 90. Умный и соображающий человек. Порядочный по сравнению со многими коллегами. Николаев не первый раз судит дерби ЦСКА – «Спартак» и является подходящей кандидатурой для такого ответственного матча. Николаеве в моём представлении является лучшим российским арбитром за последние два года.