1-й тур
30.07.2016	зенит	0:0	локомотив	17:30
30.07.2016	анжи	0:0	цкг	20:00
30.07.2016	Ростов	1:0	Оренбург	21:30
31.07.2016	Урал	2:0	Уфа	15:30
31.07.2016	Спартак	4:0	Арсенал	18:00
31.07.2016	терек	1:0	Кр. Советов	20:30
01.08.2016	Краснодар	3:0	Томь	19:30
01.08.2016	Рубин	0:0	Амкар	19:30

2-й тур
06.08.2016	Уфа	0:0	зенит	17:00
06.08.2016	Арсенал	1:0	Рубин	19:30
07.08.2016	Оренбург	0:1	цкг	14:00
07.08.2016	Амкар	2:0	анжи	16:30
07.08.2016	локомотив	2:2	Томь	19:00
07.08.2016	Ростов	0:0	Урал	21:30
08.08.2016	Спартак	1:0	Кр. Советов	19:30
08.08.2016	Краснодар	4:0	терек	19:30

3-й тур
12.08.2016	зенит	3:2	Ростов	19:30
13.08.2016	Урал	0:1	цкг	15:30
13.08.2016	Кр. Советов	1:1	Краснодар	18:00
13.08.2016	Рубин	1:1	Спартак	20:30
14.08.2016	Томь	1:0	Уфа	17:30
14.08.2016	анжи	1:0	Арсенал	20:00
14.08.2016	терек	1:1	локомотив	20:30
15.08.2016	Оренбург	0:0	Амкар	17:30

4-й тур
19.08.2016	Рубин	1:2	анжи	19:30
20.08.2016	Уфа	1:3	терек	14:30
20.08.2016	зенит	1:1	цкг	17:00
20.08.2016	Ростов	3:0	Томь	21:30
21.08.2016	Амкар	1:0	Урал	15:30
21.08.2016	Спартак	2:0	Краснодар	18:00
21.08.2016	локомотив	0:0	Кр. Советов	20:30
22.08.2016	Арсенал	0:0	Оренбург	19:30

5-й тур
26.08.2016	Кр. Советов	0:1	Уфа	18:30
27.08.2016	Оренбург	1:1	Рубин	13:00
27.08.2016	Томь	0:1	цкг	15:30
27.08.2016	зенит	3:0	Амкар	18:00
28.08.2016	Урал	1:1	Арсенал	17:00
28.08.2016	терек	2:1	Ростов	19:15
28.08.2016	Краснодар	1:2	локомотив	19:15
28.08.2016	анжи	0:2	Спартак	21:30

6-й тур
11.09.2016	Спартак	1:0	локомотив	16:30
12.09.2016	Рубин	3:1	Урал	19:30
10.09.2016	Оренбург	0:0	анжи	18:00
11.09.2016	Арсенал	0:5	зенит	19:00
10.09.2016	Амкар	1:0	Томь	15:30
10.09.2016	цкг	3:0	терек	20:30
09.09.2016	Ростов	2:1	Кр. Советов	20:00
11.09.2016	Уфа	0:0	Краснодар	14:00

7-й тур
16.09.2016	Оренбург	1:3	Спартак	17:00
17.09.2016	Урал	0:1	анжи	16:30
19.09.2016	зенит	4:1	Рубин	19:30
17.09.2016	Томь	1:0	Арсенал	14:00
17.09.2016	терек	1:3	Амкар	19:00
18.09.2016	Кр. Советов	1:2	цкг	17:15
18.09.2016	Краснодар	2:1	Ростов	20:00
16.09.2016	локомотив	0:1	Уфа	18:30

8-й тур
25.09.2016	Спартак	0:1	Уфа	17:00
26.09.2016	Рубин	2:1	Томь	19:30
25.09.2016	анжи	2:2	зенит	19:30
25.09.2016	Оренбург	0:1	Урал	12:00
25.09.2016	Арсенал	0:0	терек	14:30
26.09.2016	Амкар	0:0	Кр. Советов	17:00
24.09.2016	цкг	1:1	Краснодар	17:00
24.09.2016	Ростов	1:0	локомотив	21:30

9-й тур
02.10.2016	зенит	4:2	Спартак	16:30
01.10.2016	терек	2:1	Оренбург	19:30
01.10.2016	Томь	1:1	Урал	12:00
02.10.2016	Ростов	1:0	цкг	21:30
01.10.2016	Кр. Советов	2:1	анжи	14:30
02.10.2016	Краснодар	1:0	Рубин	19:00
01.10.2016	локомотив	1:1	Арсенал	17:00
02.10.2016	Уфа	1:1	Амкар	14:00

10-й тур
15.10.2016	Спартак	1:0	Ростов	19:30
15.10.2016	Рубин	3:0	Кр. Советов	17:00
17.10.2016	анжи	0:0	терек	19:30
16.10.2016	Оренбург	3:1	Томь	16:30
16.10.2016	Урал	0:2	зенит	14:00
16.10.2016	Арсенал	0:0	Краснодар	19:00
15.10.2016	Амкар	0:0	локомотив	14:30
14.10.2016	цкг	1:0	Уфа	19:30

11-й тур
22.10.2016	Урал	0:1	Спартак	17:00
23.10.2016	Краснодар	1:0	Амкар	19:00
21.10.2016	Кр. Советов	1:1	Арсенал	18:00
22.10.2016	терек	3:1	Рубин	19:30
22.10.2016	Томь	0:3	анжи	12:00
23.10.2016	локомотив	1:0	цкг	16:30
22.10.2016	Уфа	0:0	Ростов	14:30
24.10.2016	зенит	1:0	Оренбург	19:30

12-й тур
29.10.2016	Спартак	3:1	цкг	18:00
31.10.2016	Рубин	2:0	локомотив	19:30
30.10.2016	анжи	0:0	Краснодар	19:30
31.10.2016	Оренбург	1:0	Кр. Советов	15:00
30.10.2016	зенит	1:0	Томь	17:00
30.10.2016	Урал	1:4	терек	12:00
30.10.2016	Арсенал	0:2	Уфа	14:30
29.10.2016	Амкар	1:0	Ростов	15:30

13-й тур
05.11.2016	Томь	0:1	Спартак	11:00
05.11.2016	Уфа	2:3	Рубин	13:30
05.11.2016	локомотив	4:0	анжи	18:30
06.11.2016	Краснодар	3:3	Оренбург	19:30
05.11.2016	Кр. Советов	2:2	Урал	16:00
06.11.2016	терек	2:1	зенит	17:00
06.11.2016	Ростов	4:1	Арсенал	17:00
06.11.2016	цкг	2:2	Амкар	14:30

14-й тур
20.11.2016	Спартак	1:0	Амкар	17:00
18.11.2016	Рубин	0:0	Ростов	19:30
19.11.2016	анжи	0:1	Уфа	17:00
19.11.2016	Оренбург	1:1	локомотив	14:30
20.11.2016	зенит	3:1	Кр. Советов	19:30
20.11.2016	Краснодар	3:0	Урал	19:00
19.11.2016	терек	0:0	Томь	12:00
18.11.2016	Арсенал	0:1	цкг	19:00

15-й тур
26.11.2016	терек	0:1	Спартак	18:00
26.11.2016	цкг	0:0	Рубин	14:00
27.11.2016	Ростов	2:0	анжи	16:30
25.11.2016	Уфа	1:0	Оренбург	17:00
26.11.2016	локомотив	1:1	Урал	17:00
27.11.2016	Краснодар	2:1	зенит	19:00
27.11.2016	Кр. Советов	3:0	Томь	14:00
26.11.2016	Амкар	1:0	Арсенал	11:30

16-й тур
01.12.2016	Кр. Советов	4:0	Спартак	18:00
30.11.2016	Рубин	1:0	Арсенал	19:00
01.12.2016	анжи	3:1	Амкар	20:30
30.11.2016	цкг	2:0	Оренбург	19:30
30.11.2016	зенит	2:0	Уфа	19:30
30.11.2016	Урал	1:0	Ростов	17:00
01.12.2016	Томь	1:6	локомотив	15:00
01.12.2016	терек	2:1	Краснодар	18:00

17-й тур
05.12.2016	Спартак	2:1	Рубин	19:30
05.12.2016	Арсенал	1:0	анжи	19:30
05.12.2016	Амкар	3:0	Оренбург	17:00
03.12.2016	цкг	4:0	Урал	14:00
03.12.2016	Ростов	0:0	зенит	19:00
05.12.2016	Уфа	1:0	Томь	17:00
04.12.2016	локомотив	2:0	терек	16:00
04.12.2016	Краснодар	1:1	Кр. Советов	18:30

18-й тур
05.03.2017	Краснодар	2:2	Спартак	16:30
06.03.2017	анжи	0:1	Рубин	19:30
04.03.2017	Оренбург	3:0	Арсенал	14:00
04.03.2017	цкг	0:0	зенит	16:30
05.03.2017	Урал	1:0	Амкар	11:30
03.03.2017	Томь	0:6	Ростов	19:00
05.03.2017	терек	0:1	Уфа	19:00
05.03.2017	Кр. Советов	0:3	локомотив	14:00

19-й тур
12.03.2017	Спартак	1:0	анжи	16:30
11.03.2017	Рубин	0:0	Оренбург	16:30
10.03.2017	Арсенал	2:0	Урал	19:00
12.03.2017	Амкар	1:0	зенит	11:30
11.03.2017	цкг	4:0	Томь	14:00
12.03.2017	Ростов	0:0	терек	19:00
11.03.2017	Уфа	1:0	Кр. Советов	11:30
13.03.2017	локомотив		Краснодар	19:30

20-й тур
18.03.2017	локомотив	1:1	Спартак	16:30
19.03.2017	зенит	2:0	Арсенал	19:30
17.03.2017	анжи	1:0	Оренбург	19:00
18.03.2017	Урал	1:0	Рубин	14:00
18.03.2017	Томь	1:0	Амкар	11:30
19.03.2017	терек	0:1	цкг	16:30
19.03.2017	Кр. Советов	0:0	Ростов	14:00
19.03.2017	Краснодар	0:0	Уфа	16:30

21-й тур
01.04.2017	Арсенал	3:0	Томь	17:30
02.04.2017	Амкар	1:1	терек	11:30
02.04.2017	цкг	2:1	Кр. Советов	16:30
03.04.2017	Ростов	0:0	Краснодар	19:30
01.04.2017	Уфа	0:1	локомотив	15:00
03.04.2017	Спартак	3:2	Оренбург	19:30
02.04.2017	Рубин	0:2	зенит	14:00
31.03.2017	анжи	2:3	Урал	19:30

22-й тур
09.04.2017	Уфа	1:3	Спартак	14:00
10.04.2017	Томь	2:2	Рубин	15:00
10.04.2017	Урал	2:0	Оренбург	17:30
08.04.2017	зенит	1:1	анжи	19:00
08.04.2017	терек	3:1	Арсенал	16:30
08.04.2017	Кр. Советов	2:2	Амкар	14:00
09.04.2017	Краснодар	1:1	цкг	16:30
09.04.2017	локомотив	0:0	Ростов	19:00

23-й тур
16.04.2017	Спартак	2:1	зенит	20:00
15.04.2017	Рубин	0:1	Краснодар	19:30
15.04.2017	анжи	1:3	Кр. Советов	17:00
16.04.2017	Оренбург	2:1	терек	12:30
16.04.2017	Арсенал	0:3	локомотив	17:30
15.04.2017	Амкар	1:1	Уфа	12:00
15.04.2017	цкг	0:0	Ростов	14:30
16.04.2017	Урал	1:0	Томь	15:00

24-й тур
22.04.2017	Ростов	3:0	Спартак	16:30
23.04.2017	Кр. Советов	0:0	Рубин	14:30
22.04.2017	терек	0:1	анжи	19:00
23.04.2017	Томь	1:2	Оренбург	12:00
22.04.2017	зенит	2:0	Урал	14:00
23.04.2017	Краснодар	2:0	Арсенал	17:00
22.04.2017	локомотив	3:3	Амкар	16:30
21.04.2017	Уфа	0:2	цкг	17:00

25-й тур
25.04.2017	Спартак	1:0	Урал	19:30
26.04.2017	Рубин	0:1	терек	19:30
27.04.2017	анжи	3:3	Томь	19:30
26.04.2017	Оренбург	0:1	зенит	17:00
25.04.2017	Ростов	1:0	Уфа	19:30
26.04.2017	Арсенал	2:0	Кр. Советов	19:30
27.04.2017	Амкар	0:2	Краснодар	17:00
26.04.2017	цкг	4:0	локомотив	19:30

26-й тур
30.04.2017	цкг	1:2	Спартак	17:00
29.04.2017	локомотив	0:1	Рубин	16:30
01.05.2017	Краснодар	0:0	анжи	18:00
01.05.2017	Кр. Советов	1:1	Оренбург	15:30
29.04.2017	терек	5:2	Урал	19:00
01.05.2017	Томь	0:2	зенит	13:00
30.04.2017	Уфа	1:2	Арсенал	14:30
30.04.2017	Ростов	1:0	Амкар	19:30

27-й тур
06.05.2017	Спартак	1:0	Томь	19:00
07.05.2017	Рубин	2:1	Уфа	16:30
08.05.2017	анжи	0:0	локомотив	17:00
07.05.2017	Оренбург	1:0	Краснодар	14:00
07.05.2017	зенит	0:1	терек	19:00
08.05.2017	Урал	1:3	Кр. Советов	14:30
06.05.2017	Арсенал	1:0	Ростов	16:30
06.05.2017	Амкар	0:2	цкг	14:00

28-й тур
13.05.2017	Амкар	0:1	Спартак	14:30
14.05.2017	Ростов	4:2	Рубин	19:00
14.05.2017	Уфа	2:1	анжи	16:30
13.05.2017	локомотив	4:0	Оренбург	19:30
13.05.2017	Урал	1:1	Краснодар	12:00
13.05.2017	Кр. Советов	1:3	зенит	17:00
14.05.2017	Томь	1:2	терек	12:00
12.05.2017	цкг	3:0	Арсенал	19:30

29-й тур
17.05.2017	Спартак	3:0	терек	19:30
17.05.2017	Рубин	0:2	цкг	19:30
17.05.2017	анжи	1:2	Ростов	19:30
17.05.2017	Оренбург	1:1	Уфа	17:30
17.05.2017	зенит	1:0	Краснодар	19:30
17.05.2017	Урал	1:2	локомотив	17:30
17.05.2017	Томь	0:2	Кр. Советов	15:00
17.05.2017	Арсенал	0:0	Амкар	19:30

30-й тур
21.05.2017	Арсенал	3:0	Спартак
21.05.2017	Амкар	1:2	Рубин
21.05.2017	цкг	4:0	анжи
21.05.2017	Оренбург	2:0	Ростов
21.05.2017	Уфа	1:0	Урал
21.05.2017	локомотив	0:2	зенит
21.05.2017	Томь	1:5	Краснодар
21.05.2017	Кр. Советов	1:3	терек

* Клубы, занявшие 15-е и 16-е места, вылетают в Футбольную Национальную Лигу (первый дивизион).

* Клубы, занявший 13-е и 14-е места, проведут стыковые матчи с 3-й и 4-й командой ФНЛ за место в элите в следующем сезоне.

1 место - групповой этап Лиги Чемпионов 2016/2017

2 место - 3-й квалификационный раунд Лиги Чемпионов 2016/2017

3 место - 3-й квалификационный раунд Лиги Европы 2016/2017

4 место - 3-й квалификационный раунд Лиги Европы 2016/2017

Обладатель Кубка России 2016/2017 - групповой этап Лиги Европы 2017/2018

Стыковые матчи за место в Премьер Лиге в сезоне 2016/2017

4 место ФНЛ - 13 место Премьер Лиги
13 место Премьер Лиги - 4 место ФНЛ

3 место ФНЛ - 14 место Премьер Лиги
14 место Премьер Лиги - 3 место ФНЛ