XXI Чемпионат России по футболу среди клубов Премьер-лиги прошел в 2012—2013 годах. Этот сезон стал первым, полностью организованным по формату «осень-весна» — после переходного чемпионата 2011—2012 годов. Чемпионский титул завоевал ЦСКА. Призовые места заняли «Зенит» Санкт-Петербург и «Анжи» Махачкала. Лучшими бомбардирами стали Вандерсон, выступавший за клуб «Краснодар» и Юра Мовсисян, который выступил за «Краснодар» и «Спартак» Москва; оба отличились по 13 раз.

Сроки проведения и формат соревнования
Чемпионат начался 20 июля 2012 года. Осенний этап продлился до 9 декабря 2012 года, весенний прошёл с 8 марта по 26 мая 2013 года.

В преддверии турнира первоначальные сроки (осенний этап должен был продлиться до 13 декабря, весенний пройти с 10 марта по 19 мая) подверглись критике в прессе: по мнению ряда обозревателей, во избежание необходимости проводить матчи в холодную погоду на полях плохого качества первую часть чемпионата можно было бы начать и закончить раньше, а вторую — позже.

22 ноября 2012 года на заседании Бюро Исполкома было принято решение о переносе 20-го тура на 9-11 марта со смещением каждого последующего из туров на дату последующего за ним тура, а 30-й тур должен состояться 26 мая. Одновременно было принято решение о переносе финала кубка России 2012/13 с 26 мая 2013 на 1 июня 2013. Кроме того, были сдвинуты сроки проведения стыковых матчей

В чемпионате принимали участие 16 команд, которые сыграли между собой в два круга. Таким образом, в турнире было сыграно 30 туров с 240 матчами.

Изменения
По итогам сезона 2011/2012 Премьер-лигу покинули следующие клубы:

«Томь» Томск — 15-е место, 37 очков. Выступал в премьер-лиге 7 сезонов подряд (с 2005 года).
«Спартак-Нальчик» — 16-е место, 34 очка. Выступал в премьер-лиге 6 сезонов подряд (с 2006 года).

По итогам первенства ФНЛ 2011/2012 в Премьер-лигу вышли следующие клубы:

«Мордовия» Саранск — 1-е место, 100 очков. Для него чемпионат стал дебютным в высшем дивизионе чемпионатов России.
«Алания» Владикавказ — 2-е место, 97 очков. Вернулся спустя сезон (последнее выступление в Премьер-лиге — в сезоне 2010).
Также по результатам стыковых матчей с командами ФНЛ «Волга» Нижний Новгород и «Ростов» сохранили себе место в Премьер-лиге.