Чемпионат России по футболу 2016/2017 — 25-й по счёту сезон высшего дивизиона системы футбольных лиг России. 5-й сезон, который организуется по системе «осень—весна».

Чемпионский титул защищал московский цкг, занявший в итоге 2 место, чемпионом за три тура до конца стал «Спартак» (завоевав золотые медали в 10 раз в рамках чемпионата России (чего не случалось с 2001 года) и 22 раза с учётом чемпионата СССР).

Формат
Чемпионат России по футболу 2016/2017 проводится по принципу «каждый с каждым» в два круга на своём поле и поле соперника. Команды клубов, занявшие 15-е и 16-е места в итоговой турнирной таблице чемпионата 2016/2017, выбывают в Первенство ФНЛ после соблюдения процедуры выбывания клубов из премьер-лиги. Команды, занявшие 13-е и 14-е места, играют по два переходных матча (дома и в гостях) с командами Первенства ФНЛ 2016/2017, занявшими соответственно четвёртое и третье места.

Победителем переходных матчей признаётся команда, которая забьёт большее количество голов в двух матчах, а при равенстве забитых голов — команда, забившая большее количество голов на чужом поле. В случае, если команды забьют равное количество голов на своём и чужом поле, то после второго матча назначаются два дополнительных тайма по 15 минут каждый без перерыва. Если в течение дополнительного времени обе команды забьют равное количество голов, то победителем будет команда, играющая в этом матче в гостях. Если в течение дополнительного времени голы не будут забиты, то победитель будет определён с помощью ударов с 11-метровой отметки в соответствии с Правилами игры.

Команды, занявшие первое и второе места в Первенстве ФНЛ 2016/2017, а также победители стыковых матчей получают право выступать в сезоне 2017/2018 в Чемпионате России. Команды, проигравшие по итогам переходных матчей сезона 2016/2017, выступают в Первенстве ФНЛ 2017/2018.

Лимит на легионеров
В составе одной команды одновременно на поле могут находиться не более 6 легионеров.

Клубы-участники
В этом чемпионате России из 16 клубов-участников три представляют Москву (минимальное число за всё время проведения чемпионатов), одним клубом представлены Грозный, Екатеринбург, Казань, Краснодар, Махачкала, Оренбург, Пермь, Ростов-на-Дону, Самара, Санкт-Петербург, Томск, Тула и Уфа.

Изменения
По итогам прошлого сезона в Футбольную национальную лигу выбыли следующие клубы:

ФК «Кубань» (Краснодар), занявший 14 место, проигравший клубу «Томь» в стыковых матчах. Вылетел в ФНЛ 5 сезонов спустя.
ФК «Динамо» (Москва), занявший 15 место. Вылетел в ФНЛ впервые в своей истории;
ФК «Мордовия» (Саранск), занявший 16 место. Возвращался в ФНЛ спустя 2 сезона.

По итогам Первенства ФНЛ 2015/2016 в Премьер-лигу вышли следующие клубы:

ФК «Оренбург» (Оренбург), занявший 1 место и вышедший в элитный дивизион впервые в своей истории;
ФК «Арсенал» (Тула), занявший 2 место и вернувшийся в элиту сезон спустя.
ФК «Томь» (Томск), занявший 3 место, обыгравший «Кубань» в стыковых матчах и вернувшийся в премьер-лигу 2 сезона спустя.